RT-ПЛР тест для виявлення 12 мутацій гена MEFV при сімейній середземноморській лихоманці (FMF)
Цей RT-ПЛР (зворотна транскрипція-полімеразна ланцюгова реакція) тест є високочутливим молекулярно-генетичним інструментом для діагностики сімейної середземноморської лихоманки (FMF) – аутосомно-рецесивного аутоімунного захворювання, яке характеризується рецидивуючими нападами лихоманки, болем у животі, грудях, суглобах та потенційним ризиком амілоїдозу (відкладення амілоїду в органах, зокрема нирках). Мутації в гені MEFV призводять до порушення функції білка пірін, що регулює запалення через інфламасому NLRP3.
Тест спеціально адаптований для використання в Україні, де FMF є рідкісним захворюванням (поширеність 1:10 000 серед етнічних українців), але симптоматичні пацієнти переважно належать до етнічних меншин з середземноморським походженням: вірменської, турецької, кримськотатарської або арабської (наприклад, сирійської, палестинської, ліванської). Ці групи мають вищий ризик носійства мутацій (до 1:5 у деяких популяціях), що робить тест актуальним для діагностики в регіонах з міграційними спільнотами).
Принцип роботи тесту:
Тест базується на RT-ПЛР технології з використанням специфічних праймерів для ампліфікації та детекції 12 ключових мутацій гена MEFV. Зразки (кров, слина або букальний мазок) обробляються в лабораторних умовах. Результати доступні протягом 24-48 годин, з чутливістю >99% та специфічністю >98%. Тест охоплює мутації, релевантні для FMF, які є "фундаторськими" (походженням з давніх популяцій) і асоційовані з тяжким перебігом захворювання, включаючи ризик амілоїдозу. Він не виявляє рідкісні мутації або мозаїцизм – для цього рекомендується повне секвенування гена.
Переваги тесту:
Рекомендації щодо використання:
Склад тесту:
Тест виявляє наступні 12 мутацій, релевантних до FMF (мутації не пов'язані з вірусом, а з генетичним захворюванням – уточнення для уникнення плутанини з "Fever Virus", ймовірно, опискою в запиті):
| Екзон | Зміна нуклеотиду | Зміна білка |
Клінічна значимість
|
|---|---|---|---|
| 5 | 1437 C>G | F479L |
Рідкісна мутація; асоційована з помірним фенотипом, часто в комплексі з іншими.
|
| 10 | 2040 G>C | M680I (G/C) | Фундаторська; тяжкий перебіг, високий ризик амілоїдозу в гомозиготах. |
| 10 | 2076_2078del | I692del | Внутрішньорамкова делеція; може проявлятися домінантно, ризик амілоїдозу ~15%. |
| 10 | 2040 G>A | M680I (G/A) | Варіант M680I; подібний до G>C. |
| 10 | 2080 A>G | M694V | Найпоширеніша та найтяжча; ранній початок, часті напади, ризик амілоїдозу 60-75%. |
| 10 | 2082 G>A | M694I | Подібна до M694V; тяжкий фенотип. |
| 10 | 2177 T>C | V726A | Подібна до M694V; тяжкий фенотип. |
| 10 | 2084 A>G | K695R | Рідкісна; м'який фенотип, часто в комбінації з іншими мутаціями. |
| 10 | 2230 G>T | A744S | Асоційована з еризипелоїдною еритемою; помірна тяжкість. |
| 10 | 2282 G>A | R761H | Варіабельна пенетрантність; м'який до помірного фенотипу. |
| 3 | 1105 C>T | P369S | Часто в комплексі з R408Q; м'які симптоми, пролонгована лихоманка з міалгією. |
| 3 | 1223 G>A | R408Q | В лінкеджі з P369S; низька пенетрантність. |